كان عليٌّ من الأوفياءِ لعُثمانَ، مناصِحًا له، وكان يقضي في عهدِه، وكان من مستشاريه، وقد ذَكَر الشِّيعةُ في كتُبِهم عِدَّةَ قضايا لعليٍّ في زمَنِ عُثمانَ رَضِيَ اللَّهُ عنهما 1048 .
فعن أبي جَعفَرٍ محمَّدٍ الباقِرِ قال: (إنَّ الوليدَ بنَ عُقبةَ حين شُهِد عليه بشُربِ الخَمرِ قال عُثمانُ لعَليٍّ عليه السَّلامُ: اقْضِ بينه وبين هؤلاء الذين زعموا أنَّه شَرِب الخَمرَ، فأمَر عليٌّ عليه السَّلامُ فجُلِدَ بسَوطٍ له شُعبتانِ أربعينَ جَلدةً) 1049 .
وكان أهلُ البيتِ يُقِرُّون بخلافةِ عُثمانَ، ويَقبَلون المناصِبَ في عهدِه، ومن ذلك توَلِّي عبدِ اللَّهِ بنِ عَبَّاسٍ الحَجَّ بالنَّاسِ في آخِرِ حياةِ عُثمانَ 1050 .